access_time Publié 21.10.2020

Corrélation entre la détection positive d’ARN du SARS-CoV-2 et les cultures virales positives

Prof. Dr méd. Reto Krapf

COVID-19 Sans détour

Corrélation entre la détection positive d’ARN du SARS-CoV-2 et les cultures virales positives

21.10.2020

Au quotidien, on oublie parfois que le test diagnostique du SARS-CoV-2 mesure l’ARN et non pas la quantité de virus (charge virale). Depuis le début de la pandémie, le doute persiste quant à savoir dans quelle mesure la quantité d’ARN amplifiée est corrélée avec la probabilité de transmission. Etant donné que la méthode de RT-PCR est extrêmement sensible, elle est capable, en cas de nombre suffisant de cycles d’amplification (exprimé en valeur Ct), de détecter même une seule molécule d’ARN. Mais les résultats qui montrent de l’ARN après de nombreux cycles (par ex. 30, 35 ou encore plus) sont associés à une très faible quantité de virus ou à des virus cultivables non intacts. Ces constellations se produisent très tôt (au début de l’incubation) ou pendant la convalescence, la distinction devant être faite par le tableau clinique et/ou par des tests répétitifs.

Dans le premier cas, l’individu est ou devient infectieux, dans le second, il est très probable qu’il ne le soit pas. Un groupe de travail franco-vietnamien a désormais mis en corrélation de façon prospective le nombre de cycles d’amplification (valeur Ct) et la positivité de la culture virale. Les cultures virales étaient positives dans 70% des cas pour une valeur Ct de 25, dans 20% des cas après 30 cycles et seulement dans 3% des cas après 35 cycles. Ce travail est très important dans une optique d’amélioration supplémentaire de l’évaluation individuelle de l’infectiosité et en tant que base décisionnelle quant à l’indication et à la durée d’une quarantaine.

 

Clin Infect Dis. 2020, doi.org/10.1093/cid/ciaa1491

© CDC/ Hannah A Bullock, Azaibi Tamin

Prof. Dr méd. Reto Krapf

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